Missing coverage evidence...
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CAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACG  >  minE/2053936‑2053997                                                              | cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:51414/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:895151/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:856742/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:8382/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:780281/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:770144/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:75049/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:690536/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:589949/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:576798/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:529899/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:1010286/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:513302/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:427109/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:39954/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:346444/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:27507/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:264817/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:194200/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:138450/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:107546/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:1030443/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:1024401/62‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:1016605/62‑1 (MQ=255)  aGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:629934/61‑1 (MQ=255)        tGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:326520/55‑1 (MQ=255)                    gcggcgTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:661283/43‑1 (MQ=255)                           gAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACg  <  1:827083/36‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGCGTTGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATTCGGCCTACGCAATCGTTGACAACG  >  minE/2053936‑2053997

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑