Missing coverage evidence...
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CGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCT  >  minE/2055775‑2055831                                                         | cGGAGTAATGGCGGGAGCCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:520250/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:786059/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:705605/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:708298/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:709888/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:72240/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:737886/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:769973/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:779745/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:78365/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:638312/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:790142/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:806824/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:864145/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:876892/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:884746/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:907380/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:949060/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:971448/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:465497/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:20684/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:210498/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:227174/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:24968/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:312191/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:376833/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:415570/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:145121/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:478839/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:481224/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:496618/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:512469/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:561191/57‑1 (MQ=255) cGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:601099/57‑1 (MQ=255)    aGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:359279/54‑1 (MQ=255)                 aCCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCt  <  1:533069/41‑1 (MQ=255)                                                         | CGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGATACTCGTCGCT  >  minE/2055775‑2055831

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑