Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2063863	2063973	111	79 [0]	[0] 30	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

CCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGATA  >  minE/2063801‑2063862                                                              | ctctGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:179617/59‑1 (MQ=255)        caGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:882851/54‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGATGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:519250/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:741060/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:779099/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:724194/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:703039/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:686850/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:683767/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:680930/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:675746/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:674683/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:634288/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:633404/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:626801/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:614256/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:572220/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:570127/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:557747/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:525793/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:523251/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:913959/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:1009080/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:97465/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:957178/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:95676/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:953101/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:943367/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:928186/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:924606/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:777164/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:900015/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:899549/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:883483/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:870766/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:840420/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:815559/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:794760/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:992053/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:139236/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:251236/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:501023/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:242941/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:238195/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:223107/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:215903/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:209294/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:17508/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:243243/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:13013/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:123381/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:119191/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:108336/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:102137/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:101982/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:1019359/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:1019047/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:403216/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:499538/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:493932/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:491642/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:481298/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:478044/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:426236/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:407337/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:25375/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:355009/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:348665/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:340807/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:300446/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:273044/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:255051/55‑1 (MQ=255)        aaGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTACCGGAAGata  <  1:973672/55‑1 (MQ=255)         aGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:176678/54‑1 (MQ=255)         aGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:381645/54‑1 (MQ=255)         aGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:381137/54‑1 (MQ=255)         aGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:828263/54‑1 (MQ=255)         aGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:106073/54‑1 (MQ=255)                aGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGata  <  1:58330/47‑1 (MQ=255)                                                              | CCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCCGGAAGATA  >  minE/2063801‑2063862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑