Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2069151	2069288	138	44 [0]	[0] 40	aer	fused signal transducer for aerotaxis sensory component and methyl accepting chemotaxis component

TTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATT  >  minE/2069089‑2069150                                                              | ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:808540/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:618843/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:634837/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:653673/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:65451/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:702955/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:703964/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:710848/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:724484/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:770016/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:798463/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:558448/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:818217/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:81957/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:857927/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:88921/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:909791/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:926430/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:943621/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:952458/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:966473/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:979368/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:277949/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:1037257/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:120916/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:136577/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:14697/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:172326/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:186027/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:205783/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:212542/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:241120/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:241245/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:1015429/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:305496/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:308253/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:319593/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:322015/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:334447/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:372244/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:404445/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:405117/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:47974/1‑62 (MQ=255) ttCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACAtt  >  1:536460/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATT  >  minE/2069089‑2069150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑