Missing coverage evidence...
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CCACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATCGCG  >  minE/2104999‑2105060                                                              | ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:799715/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:546179/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:561314/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:572134/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:589474/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:599662/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:631429/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:652251/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:730113/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:775072/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:784472/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:79282/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:48478/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:835654/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:854840/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:861313/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:871133/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:917816/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:921731/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:963329/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:970800/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:972791/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:982980/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:99291/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:322595/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:102675/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:133840/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:137921/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:169843/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:220555/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:262409/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:267443/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:284889/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:298912/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:302432/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:1022389/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:348155/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:355788/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:357027/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:372182/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:395185/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:424920/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:444850/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:447976/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:456556/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATagcg  >  1:168518/1‑62 (MQ=255) ccACTACCACGGTGACGGCAACGAGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATcgcg  >  1:347714/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCACTACCACGGTGACGGCAACGCGCGTCGTCTGGCGCGTGGTTATAGCTACTCGGATCGCG  >  minE/2104999‑2105060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑