Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2109864	2109988	125	24 [0]	[0] 26	agaC	N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS

CCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATT  >  minE/2109803‑2109863                                                             | cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:421350/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:985475/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:981134/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:834486/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:822672/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:708591/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:705079/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:675135/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:663256/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:554647/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:543592/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:496593/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:103514/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:327889/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:260888/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:260799/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:193635/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:140204/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:134819/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:132292/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:116029/61‑1 (MQ=255) cccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGAGTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:388378/61‑1 (MQ=255)  ccTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:268723/60‑1 (MQ=255)                      ttCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTAtt  <  1:192657/40‑1 (MQ=255)                                                             | CCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATT  >  minE/2109803‑2109863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑