Missing coverage evidence...
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CACACGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAT  >  minE/2118053‑2118112                                                            | cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGCTCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:75301/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:691145/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:951282/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:94822/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:9458/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:945274/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:936271/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:920912/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:911230/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:90900/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:904168/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:874365/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:835553/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:777123/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:718724/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:706014/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:1036625/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:667646/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:637142/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:595308/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:554492/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:505951/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:363898/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:353282/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:340745/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:339868/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:28876/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:28440/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:185997/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:181766/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAt  >  1:122126/1‑60 (MQ=255) cacaCGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGAAGGTACGAACCAGAt  >  1:650520/1‑60 (MQ=255)                                                            | CACACGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGAT  >  minE/2118053‑2118112

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑