Missing coverage evidence...
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CAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAG  >  minE/2129206‑2129267                                                              | cAATATTATCGCCGCCGACAGGAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:260367/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGCCGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:193132/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:732904/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:404352/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:494124/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:53675/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:5485/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:558655/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:599873/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:613136/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:660394/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:714515/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:717407/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:372250/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:744327/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:748334/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:754639/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:832854/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:839740/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:850535/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:851095/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:907035/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:916793/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:956046/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:22290/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:1018428/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:10426/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:104306/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:112319/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:119821/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:12133/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:137806/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:151170/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:179668/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:21283/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:383206/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:248287/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:255637/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:27313/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:292603/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:299926/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:305506/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:31277/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:332570/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:362059/1‑62 (MQ=255) cAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAg  >  1:1017950/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAATATTATCGCCGCCGACAGCAACCGCGACGCTGAATTTCTGTTTACCTCAATGCAGCAAG  >  minE/2129206‑2129267

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑