Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2148162 2148732 571 112 [0] [0] 42 glmM phosphoglucosamine mutase

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

CGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTT  >  minE/2148114‑2148161
                                               |
cgccATCACCTTCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:662933/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCCGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:103633/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCATCAACGATGCCTTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:179093/48‑1 (MQ=39)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCAGCGGTAGTAGtttt  <  1:76601/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:728133/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:52349/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:711574/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:699562/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:693225/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:690299/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:659103/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:638031/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:634523/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:631404/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:630729/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:627639/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:616554/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:608926/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:599089/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:590467/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:579096/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:567123/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:565953/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:535476/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:535382/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:978227/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:861080/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:1022663/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:956635/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:956237/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:94034/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:919547/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:918002/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:912486/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:901582/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:880587/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:864460/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:732585/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:852840/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:845285/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:841174/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:827568/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:826229/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:821509/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:771111/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:759386/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:745922/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:734677/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:229779/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:319982/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:306911/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:511505/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:292939/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:283859/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:268521/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:264550/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:260857/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:24274/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:233866/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:231869/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:30364/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:228622/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:227964/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:224602/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:217165/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:212315/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:194613/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:190864/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:109615/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:109237/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:104919/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:1038035/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:411500/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:509070/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:485908/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:481636/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:47565/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:464369/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:459508/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:447405/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:421258/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:417290/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:326568/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:404934/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:379036/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:373711/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:365149/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:339768/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:335824/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:335431/48‑1 (MQ=255)
cgccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:333850/48‑1 (MQ=255)
 gccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:773848/47‑1 (MQ=255)
 gccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:665627/47‑1 (MQ=255)
 gccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:75590/47‑1 (MQ=255)
 gccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:482829/47‑1 (MQ=255)
   cAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:802140/45‑1 (MQ=255)
    aGCACCTGCAAGCCAGCAACGATTCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:861875/44‑1 (MQ=255)
     gCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:945476/43‑1 (MQ=255)
          tGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:348023/38‑1 (MQ=255)
          tGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGtttt  <  1:471017/38‑1 (MQ=255)
                                               |
CGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTT  >  minE/2148114‑2148161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: