Missing coverage evidence...
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TGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTT  >  minE/2228416‑2228477                                                              | tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:533929/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:914220/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:912787/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:896910/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:893149/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:815298/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:751950/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:748068/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:635738/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:631139/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:612637/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:576827/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:1032615/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:491538/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:475539/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:454223/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:393272/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:352885/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:331986/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:327921/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:317992/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:190070/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:174671/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:137055/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:114507/62‑1 (MQ=255) tGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGGGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGtt  <  1:749227/62‑1 (MQ=255)                                                              | TGCGCATAAGTTTCCCGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTT  >  minE/2228416‑2228477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑