Missing coverage evidence...
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TTTCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAT  >  minE/2270617‑2270678                                                              | tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGCCCCCACACTACCAt  >  1:898799/1‑62 (MQ=25) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:735115/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:538841/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:572358/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:594312/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:59587/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:647692/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:649048/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:654815/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:660063/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:661104/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:675492/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:687285/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:492301/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:780789/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:823617/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:854265/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:898101/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:916069/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:922423/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:928892/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:939683/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:976757/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:268166/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:1003183/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:1007116/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:104568/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:115628/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:161014/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:168513/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:203758/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:203821/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:208704/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:22220/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:1001815/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:286813/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:293136/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:317180/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:333933/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:34701/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:364861/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:414440/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:419978/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:425412/1‑62 (MQ=35) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt  >  1:444526/1‑62 (MQ=35)                                                              | TTTCGTTTTATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAT  >  minE/2270617‑2270678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑