Missing coverage evidence...
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CGTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGG  >  minE/2302930‑2302991                                                              | cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATGGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:812301/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:818571/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:69620/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:706593/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:715007/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:734749/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:749957/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:761123/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:791665/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:795014/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:682188/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:826524/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:836180/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:872624/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:923096/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:973873/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:986992/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:988201/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:992146/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:389796/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:118000/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:152825/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:198726/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:226436/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:295667/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:424203/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:493558/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:497478/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:503815/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:517422/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:539056/62‑1 (MQ=255) cgTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:616599/62‑1 (MQ=255)  gTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:330687/61‑1 (MQ=255)  gTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:286568/61‑1 (MQ=255)  gTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:180897/61‑1 (MQ=255)  gTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:572642/61‑1 (MQ=255)                         gcagATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:1014069/38‑1 (MQ=255)                           agATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAgg  <  1:387970/36‑1 (MQ=255)                                                              | CGTAGCAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGG  >  minE/2302930‑2302991

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑