Missing coverage evidence...
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CTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCG  >  minE/2303664‑2303725                                                              | cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:54582/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:961686/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:888893/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:853539/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:833779/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:794307/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:735049/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:620754/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:568229/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:550563/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:547766/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:1015780/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:505039/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:481623/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:477524/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:458763/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:452765/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:423339/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:371386/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:315648/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:295974/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:278908/62‑1 (MQ=255) cTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:193411/62‑1 (MQ=255)  tACCAACAGCGAGCTGCGGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:59459/61‑1 (MQ=255)               ctgctgTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCg  <  1:898032/48‑1 (MQ=255)                                                              | CTACCAACAGCGAGCTGCTGTGCGAAGCGTTTCTGCATGCCTTTACCGGGCAACCTTTGCCG  >  minE/2303664‑2303725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑