Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2307650	2307686	37	27 [0]	[0] 48	cytR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATCC  >  minE/2307588‑2307649                                                              | cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:533106/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:971227/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:950868/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:946669/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:921603/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:874786/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:795447/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:787478/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:746323/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:669454/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:631551/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:576355/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:555294/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:553936/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:1015137/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:516114/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:512218/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:493282/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:478435/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:440497/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:403215/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:378451/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:298412/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:29841/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:248641/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:234248/1‑62 (MQ=255) cGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATcc  >  1:16174/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGCCCGGGAAGTGGGTTATTTACCGCAGCCTATGGGGCGCAACGTCAAGCGTAATGAATCC  >  minE/2307588‑2307649

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑