Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343358	2343700	343	24 [0]	[0] 23	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CTCGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGT  >  minE/2343296‑2343357                                                              | ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:619712/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:942346/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:901747/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:869195/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:867666/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:826257/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:815207/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:807705/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:726250/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:707078/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:683570/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:621380/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:130974/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:55474/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:547675/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:45107/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:412700/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:381220/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:368382/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:209550/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:174235/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:150720/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:147097/1‑62 (MQ=255) ctcGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTGTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGt  >  1:402138/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTCGGTTTACCTGCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGT  >  minE/2343296‑2343357

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑