Missing coverage evidence...
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AGATAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAC  >  minE/2365201‑2365262                                                              | agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:103727/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:99061/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:969261/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:944975/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:929872/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:86321/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:859698/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:838512/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:75387/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:741759/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:711064/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:579636/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:579007/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:576600/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:554986/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:501663/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:4800/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:1005353/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:461634/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:134244/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:405374/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:360311/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:283234/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:282179/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:176464/62‑1 (MQ=255) agaTAAAAGCGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:883261/62‑1 (MQ=255) agaAAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:366091/62‑1 (MQ=255)  gaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:553737/61‑1 (MQ=255)  gaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:422477/61‑1 (MQ=255)  gaTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:567402/61‑1 (MQ=255)   aTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:155992/60‑1 (MQ=255)   aTAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:111496/60‑1 (MQ=255)              cgcACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAc  <  1:324266/49‑1 (MQ=255)                                                              | AGATAAAAGGGAGCGCACCGACGCTACCCAGCACGGTCCAGAACAGCACCACTATCAGAAAC  >  minE/2365201‑2365262

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑