Missing coverage evidence...
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CAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGGCGC  >  minE/2498685‑2498746                                                              | cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCGCGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:124996/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:732461/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:1008855/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:520285/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:521488/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:57476/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:582699/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:589032/62‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTGGGCACGATGGGTTTTGGCCTGCCTGCGGCGATTGgcgc  <  1:607317/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑