Missing coverage evidence...
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GCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATC  >  minE/226942‑227003                                                              | gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:849072/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:599311/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:610741/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:650784/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:658222/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:681186/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:746548/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:770658/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:785380/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:800562/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:805959/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:581386/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:856775/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:867743/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:875119/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:894987/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:919482/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:935521/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:936770/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:94682/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:971076/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:9819/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:399095/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:1026665/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:167212/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:183580/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:255900/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:280238/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:293408/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:310920/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:318148/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:335043/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:382853/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:1013446/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:4075/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:437097/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:51831/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:521369/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:523163/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:524395/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:576358/62‑1 (MQ=255) gCAAGGATTGCTGGGACGGCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:498858/62‑1 (MQ=255)  cAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:469101/61‑1 (MQ=255)     ggATTGCGGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:165899/58‑1 (MQ=255)                            aaCGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATc  <  1:686623/35‑1 (MQ=255)                                                              | GCAAGGATTGCTGGGACGTCGCTGCCCAACGCCAATGTTATCAGGCTACTGGAAGAACGATC  >  minE/226942‑227003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑