Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2518947	2518984	38	35 [0]	[0] 10	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

ATAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGT  >  minE/2518886‑2518946                                                             | aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:742111/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:477501/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:487476/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:488345/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:503879/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:522074/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:587545/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:690636/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:726560/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:449431/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:770744/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:91582/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:941381/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:942965/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:95386/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:954110/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:97949/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:441022/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:104878/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:12883/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:1415/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:143659/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:162693/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:162970/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:183307/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:200911/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:247350/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:25417/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:282555/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:294863/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:298260/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:306676/61‑1 (MQ=255) aTAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:1015884/61‑1 (MQ=255)  tAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGt  <  1:184584/60‑1 (MQ=255)                       aGAATGCAGGCAAGCGCTACCGGGTGCGTGATTTAGGGt  <  1:95545/39‑1 (MQ=255)                                                             | ATAGTCGAGTTTCATCTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGT  >  minE/2518886‑2518946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑