Missing coverage evidence...
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CAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAC  >  minE/2521404‑2521462                                                           | cAGCCTTGCCGGTCAGTGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:481270/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:777849/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:537845/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:542878/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:562151/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:601553/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:606894/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:623275/59‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCCGGTCAGGGTATTCCTCGCATTGATGATGTGGTGTGGCGCGGTGCAGAAc  <  1:653479/59‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑