Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2544097	2544109	13	37 [0]	[0] 3	rfaL	O‑antigen ligase

CAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGA  >  minE/2544035‑2544096                                                              | cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:804395/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:519297/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:568988/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:631219/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:642274/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:673790/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:740601/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:740867/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:775171/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:781277/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:453918/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:832670/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:847544/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:849579/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:889658/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:947173/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:955691/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:978564/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:982814/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:21908/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:1015442/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:143046/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:172068/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:174223/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:176778/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:183306/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:208811/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:218581/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:1000007/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:230652/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:269436/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:273478/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:293989/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:323979/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:324606/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:346410/1‑62 (MQ=255) cAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGa  >  1:349015/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAAAAGAAATGCGGTCATTTTCATGAATGCTATTAATATACATTGCATATCCAGCAATTAGA  >  minE/2544035‑2544096

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑