Missing coverage evidence...
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GGTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAA  >  minE/2550469‑2550530                                                              | ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:457909/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:923593/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:872822/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:861567/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:794641/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:761723/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:745334/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:643082/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:638259/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:599100/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:467866/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:131761/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:434647/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:388435/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:357928/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:346759/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:336593/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:322180/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:29208/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:264513/62‑1 (MQ=255) ggTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:251219/62‑1 (MQ=255)  gtgtTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCaa  <  1:25628/61‑1 (MQ=255)                                                              | GGTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAA  >  minE/2550469‑2550530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑