Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2608492	2608625	134	47 [0]	[0] 58	[nikR]–[nikE]	[nikR],[nikE]

GACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTA  >  minE/2608432‑2608491                                                            | gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTTCGCCAGGGCGCTa  >  1:489338/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:708661/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:524433/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:525111/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:545949/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:591682/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:602102/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:615344/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:643116/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:651317/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:66521/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:666101/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:509306/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:819319/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:828872/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:869710/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:870740/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:890742/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:907975/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:957864/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:976083/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:992278/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:997551/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:999956/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:328893/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:117699/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:125686/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:151177/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:152597/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:167719/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:197497/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:198494/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:255239/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:259544/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:265196/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:314902/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:522705/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:359593/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:382779/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:399418/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:42152/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:425464/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:429060/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:472535/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:501171/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTa  >  1:1032430/1‑60 (MQ=255) gACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGAGCTa  >  1:461355/1‑60 (MQ=255)                                                            | GACAGCACCGCGAAACCTTGCGTGCCGTGCTGCTGGGTGGCCTCTTGCGCCAGGGCGCTA  >  minE/2608432‑2608491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑