Missing coverage evidence...
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TTTTTGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCCG  >  minE/2642173‑2642234                                                              | tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTTCGGGGTTTTGCcg  <  1:83608/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:52381/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:621039/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:613684/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:608763/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:603227/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:602549/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:574507/62‑1 (MQ=255) tttttGCAGGCTTCCTCGCTCGCTCCGGTCGCGTGCTGATGTACGCTTCCGGGGTTTTGCcg  <  1:537694/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑