Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2671478	2671832	355	72 [0]	[0] 31	malQ	4‑alpha‑glucanotransferase

TTGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTTA  >  minE/2671434‑2671477                                            | ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:637207/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:739571/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:737151/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:732107/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:710855/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:686736/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:6628/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:659981/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:655976/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:795153/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:62416/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:619152/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:596507/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:584722/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:583406/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:560706/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:5541/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:1037531/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:855795/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:988839/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:986866/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:985655/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:984869/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:973320/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:91285/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:90032/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:870426/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:552442/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:847849/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:837146/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:834183/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:828231/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:820548/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:807454/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:807422/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:806361/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:151484/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:548888/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:212948/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:20616/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:185697/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:173353/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:170042/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:165808/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:15569/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:215784/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:149446/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:142664/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:141922/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:139626/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:137476/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:120904/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:119244/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:111956/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:344360/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:491941/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:4919/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:475689/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:469295/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:468085/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:460789/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:455771/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:375823/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:223269/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:340239/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:320668/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:291083/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:280414/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:27138/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:25930/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGAGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:835787/1‑44 (MQ=255) ttGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGAGTGCCTGCGTTCAGCTTta  >  1:255996/1‑44 (MQ=255)                                            | TTGCTGAATAAACAAAAGCTGTGGGGTGCCTGCGTTCAGCTTTA  >  minE/2671434‑2671477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑