Missing coverage evidence...
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GGTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGAAAA  >  minE/2672544‑2672596                                                     | ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:742990/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:1015049/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:605256/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:606165/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:617962/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:638176/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:650347/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:655832/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:659550/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:580309/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:768273/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:804128/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:815674/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:817578/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:842010/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:869319/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:879098/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:948010/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:308946/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:110769/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:117953/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:123056/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:124742/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:174960/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:208379/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:260568/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:499633/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:316093/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:376762/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:383509/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:38839/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:474473/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:479385/53‑1 (MQ=255) ggTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:48211/53‑1 (MQ=255)            ctgcagcGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:128182/40‑1 (MQ=255)                agcTGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGaaaa  <  1:67394/38‑1 (MQ=255)                                                     | GGTAAGCTGCGCAGCAGCGGTGTGTACTCTTACAAAGTGCTCTATTTCGAAAA  >  minE/2672544‑2672596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑