Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2758750	2758852	103	52 [0]	[1] 58	smf	conserved hypothetical protein

TCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCA  >  minE/2758689‑2758749                                                             | tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCTACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:318066/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCGCGGCGCa  <  1:707651/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:754583/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:100824/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:561337/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:581909/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:597229/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:597801/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:642825/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:65537/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:681196/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:709132/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:744425/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:528310/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:763318/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:76849/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:794207/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:795367/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:839033/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:881589/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:922810/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:924560/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:955367/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:987649/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:999241/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:287199/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:118500/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:119732/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:144429/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:144717/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:166601/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:182689/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:185385/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:220496/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:25365/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:264461/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:283556/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:51244/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:304531/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:314192/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:315282/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:32113/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:415382/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:42265/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:480848/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:501237/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:506775/61‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACAGCGAATTTTACCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:694467/61‑1 (MQ=255)  ccTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:15770/60‑1 (MQ=255)              gAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:470518/48‑1 (MQ=255)                aTTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:775972/46‑1 (MQ=255)                    tATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCa  <  1:657412/42‑1 (MQ=255)                                                             | TCCTGCGGACAGCGAATTTTATCCTCCTCAACTTCTGGCGACGACAGATTACCCCGGCGCA  >  minE/2758689‑2758749

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑