Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2835662 2835732 71 100 [0] [0] 106 yjeJ hypothetical protein

CCGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCA  >  minE/2835600‑2835661
                                                              |
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTTAGCTCATCAACCATAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:30680/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATTTTTTCTGCCa  <  1:420268/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:63998/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:727128/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:71997/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:719914/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:711072/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:706731/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:699563/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:684791/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:680549/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:674117/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:648889/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:743751/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:637135/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:61916/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:614321/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:599887/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:594867/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:585911/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:578732/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:551362/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:1015740/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:51143/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:878755/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:992091/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:991503/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:980959/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:963949/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:937061/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:928770/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:925280/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:91931/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:917967/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:910497/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:883076/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:517314/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:859091/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:850112/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:816830/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:805875/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:790842/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:790763/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:780735/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:772770/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:763455/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:754151/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:747177/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:173003/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:26971/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:501179/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:246514/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:23670/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:234179/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:227993/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:221634/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:210147/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:2089/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:202370/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:190009/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:247503/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:170990/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:154892/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:145345/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:138385/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:137758/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:132625/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:118054/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:115727/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:1038602/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:1030862/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:1016531/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:35554/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:467576/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:464022/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:459308/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:444085/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:429802/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:406952/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:393036/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:38273/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:294355/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:346715/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:342244/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:294826/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:298133/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:30223/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:335623/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:337775/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:339839/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:340925/62‑1 (MQ=255)
ccGACGATTAATATAGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:865870/62‑1 (MQ=255)
 cgacgaTTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:629880/62‑1 (MQ=255)
 cgacgaTTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:615380/61‑1 (MQ=255)
 cgacgaTTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:204746/61‑1 (MQ=255)
         aaTATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:522348/53‑1 (MQ=255)
                   tttttAAGCTCATCAACCAGAATTTCTTGGATGTTTTCTGCCa  <  1:587759/43‑1 (MQ=255)
                    ttttAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:765863/42‑1 (MQ=255)
                    ttttAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:295492/42‑1 (MQ=255)
                       tAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCa  <  1:133990/39‑1 (MQ=255)
                                                              |
CCGACGATTAATATCGGCATTTTTAAGCTCATCAACCAGAATTTCTGGGATGTTTTCTGCCA  >  minE/2835600‑2835661

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: