Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	259193	259308	116	38 [0]	[0] 45	yajD	conserved hypothetical protein

TTAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCG  >  minE/259131‑259192                                                              | ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:780470/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:616036/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:621173/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:626192/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:676720/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:688952/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:726082/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:766804/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:773153/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:1033966/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:785250/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:847076/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:888353/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:925815/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:969461/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:977464/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:980784/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:393480/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:161755/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:183973/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:216687/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:302735/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:359402/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:385278/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:129189/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:389613/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:394149/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:449533/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:507693/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:549576/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCAGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:580460/62‑1 (MQ=255) ttAAAAATCTATCCGTGGGGCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:699507/62‑1 (MQ=255)  tAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:415996/61‑1 (MQ=255)  tAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:551136/61‑1 (MQ=255)  tAAAAATCTATCCGTGGGGCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:551328/61‑1 (MQ=255)                    tCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:120665/43‑1 (MQ=255)                         ggTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCATCCTGCg  <  1:1011626/38‑1 (MQ=255)                           tCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCg  <  1:771153/36‑1 (MQ=255)                                                              | TTAAAAATCTATCCGTGGGTCTGCGGTCGCTGTTCCCGCGAGTTTGTTTATTCCAACCTGCG  >  minE/259131‑259192

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑