Missing coverage evidence...
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GATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATC  >  minE/2893812‑2893873                                                              | gagctcctcCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:245370/59‑1 (MQ=255) gagctcctcCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:26966/59‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCGTGCGCGATc  <  1:52774/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:838681/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:649209/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:668136/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:735757/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:748319/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:751948/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:778540/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:797773/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:81309/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:836902/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:985920/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:84937/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:87469/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:87786/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:903649/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:914773/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:934384/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:984557/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:157186/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:458960/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:175610/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:180734/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:203615/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:212330/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:305350/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:309527/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:326629/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:331652/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:383789/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:392592/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:396587/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:396835/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:423402/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:590666/62‑1 (MQ=255) gATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCGATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:420053/62‑1 (MQ=255)  aTCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:384690/61‑1 (MQ=255)        tccGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATc  <  1:352859/55‑1 (MQ=255)                                                              | GATCTCCTCCGAACTGGAAGAGCTGGTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATC  >  minE/2893812‑2893873

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑