Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2928187	2928187	1	30 [0]	[0] 52	yjgP	conserved inner membrane protein

CCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGA  >  minE/2928188‑2928231 |                                            cccAGCTGCGCGACGGCTCCCATGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:944439/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:755416/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:570420/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:578139/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:589703/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:611920/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:641505/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:648786/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:654287/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:656797/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:693538/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:703571/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:736882/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:751174/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:569255/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:7942/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:811453/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:817897/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:834409/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:845406/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:862585/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:897946/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:93032/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:957714/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:977064/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:995287/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:3626/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:1035845/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:10638/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:10730/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:113318/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:122704/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:129067/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:161399/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:163175/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:274119/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:312856/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:343334/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:361203/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:1006349/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:384829/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:419391/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:423740/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:425603/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:42932/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:484435/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:525217/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:543650/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:548548/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:549614/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:563405/44‑1 (MQ=255) cccAGCTGCGCGACGGCTCCCAGATCGTCACTCTCAACCAGGGa  <  1:505129/44‑1 (MQ=255) |                                            CCCAGCTGCGCGACGGCTCCCAGGTCGTCACTCTCAACCAGGGA  >  minE/2928188‑2928231

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑