Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2928965	2929061	97	78 [0]	[0] 44	yjgQ	conserved inner membrane protein

GGCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTA  >  minE/2929062‑2929123 |                                                              ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGTCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:262569/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTgcgc            >  1:995188/1‑52 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:623225/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:52636/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:645790/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:651367/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:690874/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:719996/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:720577/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:725048/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:733722/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:752948/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:755980/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:770545/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:776163/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:806677/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:812731/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:821721/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:847406/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:878992/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:919138/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:923596/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:954487/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:332458/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:113922/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:114240/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:150787/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:171221/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:178544/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:179348/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:199845/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:247500/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:287577/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:289199/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:100719/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:348879/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:408348/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:447672/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:460833/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:464112/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:467428/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:47991/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:487777/1‑62 (MQ=255) ggCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTa  >  1:51671/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGCGAATGGGTCGCGCCGCAGGGCGAGCAGATGGCGCGTAACTACCGTGCGCAGGCGATGTA  >  minE/2929062‑2929123

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑