Missing coverage evidence...
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CACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATT  >  minE/2949851‑2949912 |                                                              cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:628231/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:384278/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:387670/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:397738/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:461471/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:489938/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:52068/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:571025/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:572236/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:345847/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:634319/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:660574/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:668160/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:732319/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:73423/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:774924/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:84049/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:934075/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:180199/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:100928/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:1023535/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:1026860/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:1031268/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:1032440/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:110799/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:133392/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:161371/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:1003016/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:195723/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:204530/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:241892/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:26476/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:308979/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:328742/62‑1 (MQ=255) cACTTCCCTGAATATGAAATAATATACAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAAtt  <  1:23013/62‑1 (MQ=255) |                                                              CACTTCCCTGAATATGAAATAATATCCAGCGCCTCTGCGGAGGACCTTACCTTATTACAATT  >  minE/2949851‑2949912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑