Missing coverage evidence...
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TTGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCG  >  minE/2953163‑2953223 |                                                             ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCat                        >  1:600975/1‑39 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCt    >  1:443657/1‑59 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:55822/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:541815/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:946034/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:934605/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:915667/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:317206/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTc   >  1:455796/1‑60 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:779520/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:584594/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:58532/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:608657/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:690278/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:711571/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:732948/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:774943/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:986271/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:878833/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:888741/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:892330/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:901149/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:952501/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:97653/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:982987/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:1027057/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:349097/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:1036279/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:110102/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:212741/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:226179/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:244193/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:280347/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:308910/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:331690/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:342931/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:557999/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:350943/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:355858/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:38619/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:389462/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:414805/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:453295/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:478563/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:52944/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCg  >  1:54165/1‑61 (MQ=255) ttGCATCCCATCGTGGAACGGCGGCTTGGAGATGATCATATCAAAACCACCTATCACCTCg  >  1:913333/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTGCATCCCATCGTGGAACGGCGGGTTGGAGATGATCATATCAAAACGACCTTTCACCTCG  >  minE/2953163‑2953223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑