Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2954243	2954573	331	41 [1]	[0] 22	[holD]–[rimI]	[holD],[rimI]

AGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGT  >  minE/2954574‑2954634 |                                                             aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:803011/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:98574/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:983789/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:977072/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:970020/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:936159/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:935512/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:892270/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:867914/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:828295/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:82118/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:223912/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:795511/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:783360/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:777827/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:775884/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:611051/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:597567/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:590188/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:385234/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:293528/61‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGt  <  1:286983/61‑1 (MQ=255) |                                                             AGCAACCAGGGCGAGCGTTATCTCAACTTTCAGTTAACGCAAAACGGCAAAATGGCGGCGT  >  minE/2954574‑2954634

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑