Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2973896	2974045	150	107 [0]	[0] 40	nadR	bifunctional DNA‑binding transcriptional repressor and NMN adenylyltransferase

GAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGAAAA  >  minE/2974046‑2974107 |                                                              gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCaa                             >  1:333752/1‑35 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCACCGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:490932/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGtt              >  1:992596/1‑50 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:98640/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:486639/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:510331/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:644667/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:663197/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:66673/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:725168/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:745028/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:762090/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:923667/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:768605/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:790276/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:801135/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:810134/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:846876/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:871332/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:8917/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:920664/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:281057/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:117448/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:127215/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:166693/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:177572/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:180280/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:242278/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:266228/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:1014626/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:286491/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:336687/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:356882/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:424746/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:431510/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:448590/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:456455/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:457678/1‑62 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaa    >  1:187595/1‑60 (MQ=255) gAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGCGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGaaaa  >  1:14419/1‑62 (MQ=255) |                                                              GAGCCGTATCCGCACGGCTGGGATGTGTGGAGCAACGGCATCAAAAAGTTTATGGCTGAAAA  >  minE/2974046‑2974107

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑