Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2974330	2974340	11	52 [0]	[0] 47	nadR	bifunctional DNA‑binding transcriptional repressor and NMN adenylyltransferase

CCCTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAT  >  minE/2974341‑2974402 |                                                              cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAata            >  1:525343/1‑52 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGa   >  1:167309/1‑61 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGa   >  1:173647/1‑61 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:754492/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:533911/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:534603/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:57725/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:613509/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:623609/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:629502/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:689101/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:689620/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:744284/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:752750/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:754136/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:442704/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:771634/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:807059/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:823902/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:831168/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:872133/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:89292/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:91015/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:967431/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:991107/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:196995/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:103507/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:110035/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:113056/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:127990/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:128567/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:129597/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:163787/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:167529/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:190882/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:196060/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:470768/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:198029/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:200495/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:29854/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:305421/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:338605/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:348226/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:408542/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:427449/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAt  >  1:1021833/1‑62 (MQ=255) cccAGGTAAACAAACTAGCCAATATCTTCAACACAACCAGTGc                     >  1:397586/1‑43 (MQ=37) |                                                              CCCTGGTAAACAAACTTGCCAATATCTTCAACACCACCAGTGCGTGGGAATATGGCCGCGAT  >  minE/2974341‑2974402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑