Missing coverage evidence...
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GAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCATTT  >  minE/2984663‑2984724 |                                                              gAGCTTTATACGGTGCAGTAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:512309/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:874169/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:57389/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:644457/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:646754/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:663982/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:678473/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:705734/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:775730/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:815619/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:853875/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:866445/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:573270/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:874379/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:877655/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:890207/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:936429/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:95116/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:953916/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:965942/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:968883/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:978075/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:981660/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:989553/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:336585/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:120163/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:147589/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:162454/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:179187/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:190402/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:276414/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:302691/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:305002/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:307880/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:322150/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:11784/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:366375/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:404954/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:411763/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:456651/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:476488/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:505887/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:53435/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:541782/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:568916/62‑1 (MQ=255) gAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCAttt  <  1:569564/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAGCTTTATACGGTGCAGGAAGAGGATAAAACCGTGGAGCGGAAACGAAGTTTTATCCATTT  >  minE/2984663‑2984724

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑