Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	309870	309971	102	42 [0]	[0] 76	acrB	multidrug efflux system protein

CGCATCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAT  >  minE/309972‑310032 |                                                             cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGGCCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:324/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGCCCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:538988/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGAGCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:695745/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:576969/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:722274/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:688216/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:636104/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:6337/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:632946/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:610284/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:606967/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:730596/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:560974/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:557254/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:556687/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:515763/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:492017/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:484633/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:1001132/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:838307/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:974533/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:96910/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:958287/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:92560/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:867319/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:862954/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:861909/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:838818/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:838478/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:474469/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:808738/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:807391/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:798744/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:797516/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:796221/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:769457/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:741852/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:736417/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:218855/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:318709/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:309864/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:303885/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:280836/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:270019/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:25411/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:225505/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:220392/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:455933/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:197283/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:195424/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:192899/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:163552/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:153542/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:120918/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:118896/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:114067/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:323145/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:463208/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:453581/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:44117/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:414574/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:413746/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:381844/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:379476/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:374859/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:350684/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:349323/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:343202/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:335494/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:331784/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:327271/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:320941/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTGTGGCGAAt  >  1:943059/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCACCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:100806/1‑61 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTATTTATCCATCAAGTCTTTGGCGa    >  1:502914/1‑59 (MQ=255) cgcaTCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCGTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAt  >  1:450470/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGCATCAAGCGTCGCTTCAATCAGACCTTTACCTTCTTTATCCATCAAGTCTTTGGCGAAT  >  minE/309972‑310032

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑