Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	332790	333047	258	11 [0]	[0] 76	fsr	predicted fosmidomycin efflux system

TCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGCC  >  minE/333048‑333109 |                                                              tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:549633/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:689047/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:651928/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:633670/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:622374/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:605644/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:604319/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:594540/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:583726/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:571500/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:725106/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:524969/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:522331/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:521173/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:521011/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:518876/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:502451/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:496110/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:1016102/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:806255/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:98926/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:958129/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:925390/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:903962/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:895701/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:881974/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:832791/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:826166/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:825547/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:486713/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:799148/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:788588/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:785527/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:773843/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:755469/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:742174/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:734430/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:727314/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:234092/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:479398/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:343026/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:335436/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:283400/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:281620/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:266064/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:261285/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:254981/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:253749/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:343234/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:230377/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:168615/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:164581/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:132164/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:108954/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:1038257/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:1033656/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:1023078/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:410632/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:470205/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:46904/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:467500/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:455411/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:452618/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:445541/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:442918/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:425993/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:417678/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:348804/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:393968/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:385302/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:369440/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:364387/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:352683/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:352540/62‑1 (MQ=255) tCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGACGTTCGGGcc  <  1:294348/62‑1 (MQ=255) tCATGGCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGcc  <  1:68413/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCATGTCGTTCAGCAGATGTGAGAGGCTGATAGCACCTAAAATACCAAACGATGTTCGGGCC  >  minE/333048‑333109

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑