Missing coverage evidence...
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CACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGCCAC  >  minE/339022‑339083 |                                                              cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:581572/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:941862/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:908391/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:876396/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:854511/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:825014/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:758327/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:728742/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:703615/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:700161/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:683368/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:676553/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:618297/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:608591/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:107282/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:53235/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:479773/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:447856/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:430187/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:421291/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:40870/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:327117/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:289691/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:262991/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:17950/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:138085/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:137599/62‑1 (MQ=255) cACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGccac  <  1:132014/62‑1 (MQ=255) |                                                              CACTGCGGCCACAGGTTGACGCTCATCGAATAGAGCCACGCCACGCCAGTACCCAGCGCCAC  >  minE/339022‑339083

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑