Missing coverage evidence...
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ATTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGG  >  minE/347838‑347898 |                                                             aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:665894/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:991523/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:981478/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:980093/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:896699/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:851632/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:850385/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:836854/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:836852/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:796948/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:777839/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:724974/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:716796/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:715297/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:690887/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:153373/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:643282/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:643076/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:622262/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:477419/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:476661/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:460463/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:441638/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:412448/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:286131/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:283545/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:279539/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:258474/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:240904/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:210758/61‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGGGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACgg  <  1:780090/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATTCTGGCGCGTCATGTGGAAGGTGCTTCGCACATGGCGGAAGGTTATACCCGCGCAACGG  >  minE/347838‑347898

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑