Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	349692	350425	734	15 [0]	[0] 44	[hyi]–glxR	[hyi],glxR

TGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAT  >  minE/350426‑350487 |                                                              tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCt                          >  1:683040/1‑38 (MQ=33) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCa           >  1:369476/1‑53 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:585987/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:576127/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:620253/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:64383/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:693658/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:711453/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:719819/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:748584/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:751302/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:757474/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:761960/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:850705/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:857362/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:867375/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:885358/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:906583/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:911398/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:927636/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:944028/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:984951/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:992244/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:374827/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:123433/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:154975/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:157068/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:158726/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:161134/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:205825/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:218629/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:229923/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:263644/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:329241/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:1021792/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:385586/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:400844/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:401062/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:405957/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:423062/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:457169/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:459644/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:511582/1‑62 (MQ=255) tgtgCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAt  >  1:570887/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAAT  >  minE/350426‑350487

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑