Missing coverage evidence...
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ATCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGGATGA  >  minE/365464‑365524 |                                                             aTCGCCAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:338120/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGtat              >  1:378395/1‑49 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatga  >  1:996125/1‑61 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:989250/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:978081/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:976135/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:889118/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:880078/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:995194/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:847066/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:638113/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:812543/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:774088/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:753877/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:736531/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:713676/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:6762/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:35444/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:177989/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:18231/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:209002/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:267083/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:289272/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:291835/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:29272/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:1037573/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:401877/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:40798/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:464159/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:531684/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:551516/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgatg   >  1:623984/1‑60 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGgat    >  1:899718/1‑59 (MQ=255) aTCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGAGTTGAGTTCAACGTATAc            >  1:720267/1‑51 (MQ=255) |                                                             ATCGACAAATCTTCCCGTGCCTGCCAGCTCAGCGTTGAGTTCAACGTATACTCCGGGATGA  >  minE/365464‑365524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑