Missing coverage evidence...
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TCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATA  >  minE/477672‑477733 |                                                              tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:631444/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:96743/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:935077/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:932706/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:902857/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:883058/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:86830/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:848546/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:81782/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:75628/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:747391/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:707333/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:691814/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:681917/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:672758/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:154448/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:59308/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:560023/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:524733/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:469702/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:464130/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:449841/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:345175/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:328686/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:31375/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:259628/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:25824/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:18643/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:157971/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATTTGCGTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:838332/62‑1 (MQ=255) tCGAAAAATGCAAATCTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAata  <  1:436901/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATA  >  minE/477672‑477733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑