Missing coverage evidence...
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GCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTC  >  minE/479374‑479434 |                                                             gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAagc                  >  1:420014/1‑45 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGaaa         >  1:966881/1‑54 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGt   >  1:165713/1‑60 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGt   >  1:507379/1‑60 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:550430/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:987039/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:873956/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:873130/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:799384/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:747016/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:695633/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:695378/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:64432/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:565469/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:558464/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:102292/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:393810/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:360982/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:360358/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:333386/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:230426/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:163168/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:143258/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:121244/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:1025851/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCATGAAAACCGGTc  >  1:599209/1‑61 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGAACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc  >  1:823589/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTC  >  minE/479374‑479434

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑