Missing coverage evidence...
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TTGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATG  >  minE/481370‑481431 |                                                              ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:158545/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:985878/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:984345/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:977133/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:900159/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:883133/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:867128/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:808086/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:781200/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:774539/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:731768/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:711545/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:687888/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:660257/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:645015/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:630156/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:628789/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:628680/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:531715/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:529032/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:433480/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:333756/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:303583/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:283073/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:219520/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATg  <  1:146593/62‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCGCGACGATATg  <  1:64856/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTGCCTTTGTGGTACGTAAAATGACGGTGGAATATTACGCACCTGCGCGGCTCGACGATATG  >  minE/481370‑481431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑