Missing coverage evidence...
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GGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGACC  >  minE/533343‑533404 |                                                              ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAAt              >  1:390987/1‑50 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAgcc   >  1:872106/1‑59 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGccc  >  1:824637/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGa    >  1:454521/1‑60 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:809555/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:1002006/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:584346/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:587071/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:589724/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:615026/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:686390/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:69591/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:717311/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:759149/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:574778/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:828829/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:887404/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:900062/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:911952/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:922327/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:959590/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:968311/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:976022/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:976654/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:397581/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:295844/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:226387/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:304223/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:338353/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:34984/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:16247/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:159325/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:143647/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:502182/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:502840/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:11361/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:298510/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:91574/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:137148/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:906024/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:23445/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:572551/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:37937/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:417586/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:423067/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:43457/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAc   >  1:508662/1‑61 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGCAATAACCACCAGAcc  >  1:845449/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCACAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:296668/1‑62 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTACGCAAAATCCACCGGAATAAccacca      >  1:655214/1‑58 (MQ=255) ggtgcggtgGCGTTGGCGCGCTCCATCTGGTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGAcc  >  1:872714/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGTGCGGTGGCGTTGGCGCGCTCCATCTGTTCCGCAAAATCCACCGGAATAACCACCAGACC  >  minE/533343‑533404

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑