Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	540257	540460	204	8 [0]	[0] 15	rhtA	threonine and homoserine efflux system

ATCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTA  >  minE/540461‑540521 |                                                             aTCAACGAACCAATTGCGACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:476637/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:106808/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:112647/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:119550/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:156727/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:25157/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:282126/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:32715/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:412101/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:529625/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:726357/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:776767/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:864223/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:988563/61‑1 (MQ=255) aTCAACGAACCAATTGCCACCGGCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTa  <  1:25254/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATCAACGAACCAATTGCCACCGTCGCAGGGCCATGTTCCGCTCCTGCGCGTTGCCCACTTA  >  minE/540461‑540521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑