Missing coverage evidence...
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TACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAC  >  minE/546090‑546151 |                                                              tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATc                    >  1:735918/1‑44 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGa   >  1:65808/1‑61 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGa   >  1:645674/1‑61 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:989555/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:1020436/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:950929/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:880104/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:831605/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:783250/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:780634/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:708946/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:689302/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:648414/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:636227/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:62166/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:55733/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:55226/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:519705/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:442015/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:400152/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:290864/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:237124/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:233664/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:210101/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAc  >  1:135260/1‑62 (MQ=255) tACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGATATCCGGACCTg            >  1:913429/1‑52 (MQ=255) |                                                              TACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGAC  >  minE/546090‑546151

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑